IDT NGS二代測序文庫構(gòu)建接頭
——UDI-UMI全長接頭、通用短Y型接頭、接頭引物
北京澤平代理的美國進(jìn)口IDT NGS二代測序DNA文庫構(gòu)建接頭Adapter，提供即用型測序P5/P7全長接頭（UDI-UMI接頭）、通用短接頭（短Y型接頭）、測序接頭引物（Index引物），以及定制合成長、短接頭和接頭引物服務(wù)，用于靈活滿足Illumina二代測序基因文庫建庫需求。
| 應(yīng)用 |
建議接頭 |
特點 |
| 無PCR全基因組測序（WGS） |
IDT xGen UDl-UMI全長接頭 |
無PCR的應(yīng)用領(lǐng)域需要全長接頭 |
| 無PCR宏基因組學(xué) |
| 無PCR測序（初始量≥100ng） |
| 低水平突變檢測（低至約1%的頻率） |
靈敏度更高，使用UMI一致性分析去除測序錯誤 |
| 以全長、雙鏈、初始cDNA開始RNA測序 |
更量化，去除PCR重復(fù) |
| 甲基化測序 |
IDT xGen UDI-UMI 全長甲基化接頭，xGen短接頭加UDI引物對（甲基化接頭） |
亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化需要甲基化胞嘧啶 |
| 全基因組測序（WGS） |
IDT xGen短接頭加UDI引物對 |
流程簡單，使用通用接頭制備連接預(yù)混合液，并通過PCR引入樣本標(biāo)簽 |
| 宏基因組（初始量為1-250ng） |
| 外顯子測序 |
| 生殖細(xì)胞系靶系列測序（SNP、插入缺失） |
一、IDT xGen UDI-UMI全長接頭
即用型IDT xGen UDI-UMI全長接頭（完整Y型接頭），DNA添加接頭后無需進(jìn)行PCR，可直接使用Illumina測序儀進(jìn)行測序。IDT UDI-UMI全長接頭序列由與Illumina Flowcell表面oligo互補(bǔ)的P5和P7序列、用于區(qū)分不同文庫的序列特異雙端標(biāo)簽（Unique Dual Index，UDI，即Barcode，含i5/i7 Index）、測序引物結(jié)合位點（Read 1 SP 和 Read 2 SP，即Rd1 SP 和Rd2 SP）、用于區(qū)分每一個DNA分子的唯一分子標(biāo)簽（Unique Molecular Identifier, UMI）組成。
IDT UDI-UMI接頭整合了UDI接頭和UMI接頭優(yōu)勢，大大降低二代測序中的錯配風(fēng)險，更適合于靈敏檢測需求。
IDT UDI序列特異雙端標(biāo)簽（Unique Dual Index）在DNA片段兩端各添加唯一Index，通過交叉驗證Index，以區(qū)分不同文庫，減少Illumina二代測序時的標(biāo)簽串?dāng)_和交叉污染問題，提高準(zhǔn)確性。IDT Index標(biāo)簽序列由8或10個堿基組成，提供1536種Index，兼容2色和4色I(xiàn)llumina測序儀。
IDT UMI唯一分子標(biāo)簽（Unique Molecular Identifier）是短序列，在UDI基礎(chǔ)上，為文庫中的每個DNA片段上加入一個唯一的標(biāo)記，使PCR擴(kuò)增的序列具有相同的插入片段和UMI分子標(biāo)簽，用于識別原始樣本中的等位基因突變是真實的低頻突變還是文庫PCR擴(kuò)增或測序?qū)е碌腻e誤，提高突變檢測靈敏度。
二、IDT xGen 短接頭和接頭引物
即用型IDT xGen 通用短接頭，為雙鏈體接頭（通用Y型接頭，短Y接頭），直接連接DNA片段后，需使用測序接頭引物（Index引物），如UDI雙端標(biāo)簽引物、或CDI組合型雙標(biāo)簽引物，通過PCR將Index序列、P5/P7序列添加到短接頭上。
三、IDT接頭和接頭引物定制合成服務(wù)
IDT提供定制合成服務(wù)，包括可兼容Illumina TruSeq平臺、Nextera平臺的各類全長接頭、短Y接頭、Index接頭引物，支持定制單標(biāo)簽（Single Index）、序列特異雙端標(biāo)簽（Unique Dual Index, UDI）、組合型雙標(biāo)簽（Combinatorial Dual Index, CDI）、含UMI的雙端標(biāo)簽（UDI-UMI）的接頭或接頭引物。
同時，IDT提供定制合成甲基化接頭服務(wù)，包括UDI-UMI全長甲基化接頭、短甲基化接頭和UDI引物對等，用于亞硫酸鹽測序（甲基化測序）。
北京澤平代理的IDT二代測序文庫接頭和引物
| 貨號 |
引物對數(shù)量 |
產(chǎn)品 |
特點 |
| 10006914 |
反應(yīng)數(shù) 16 |
IDT xGen UDI-UMI全長接頭 |
|
| 10005903 |
反應(yīng)數(shù) 96 |
| 10005976 |
16 |
IDT xGen 通用短接頭和UDI引物 |
8nt |
| 10005921 |
96 |
8nt |
| 10005974 |
|
IDT xGen 通用短接頭 |
|
| 10005924 |
| 10005975 |
16 |
IDT xGen UDI引物 |
8nt |
| 10005922 |
96 |
8nt 1號96孔板 |
| 10009816 |
96 |
8nt 2號96孔板 |
| 10008052 |
384 |
10nt 1-4號96孔板 |
| 10008053 |
768 |
10nt 1-8號96孔板 |
| 10008054 |
1536 |
10nt 1-16號96孔板 |
| 10008055 |
384 |
10nt 1-4號96孔板，2 nmol |
| 10008056 |
768 |
10nt 1-8號96孔板，2 nmol |
| 10008057 |
1536 |
10nt 1~16號96孔板，2 nmol |
| 10009815 |
96 |
IDT xGen CDI引物 |
8nt |
| 定制 |
|
兼容TruSeq平臺的全長接頭 |
可選配單標(biāo)簽(Single Index)、組合型雙端標(biāo)簽(CDI)、序列特異雙端標(biāo)簽(UDI)或含UMI分子標(biāo)簽的雙端標(biāo)簽(UDI-UMI)。 |
| 定制 |
|
兼容TruSeq平臺的短接頭及標(biāo)簽引物 |
可選配單標(biāo)簽(Single Index)、組合型雙端標(biāo)簽(CDI)或序列特異雙端標(biāo)簽(UDI)。 |
| 定制 |
|
兼容TruSeq平臺的標(biāo)簽引物 |
可選配單標(biāo)簽(Single Index)、組合型雙端標(biāo)簽(CDI)或序列特異雙端標(biāo)簽(UDI)。 |
| 定制 |
|
兼容Nextera平臺的標(biāo)簽引物 |
可選配單標(biāo)簽(Single Index)、組合型雙端標(biāo)簽(CDI)或序列特異雙端標(biāo)簽(UDI)。 |
| 定制 |
|
甲基化接頭和接頭引物 |
甲基化全長接頭、甲基化短接頭和接頭引物 |
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